ロングリードDNA抽出用 植物組織のご準備方法
Published on 07/09/2023 16:40
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ロングリードシーケンスに使用するゲノムDNAの抽出用の植物組織の受け入れ要件について、以下にご案内いたします。
各項目をよくお読みいただいた上で、サンプルのご準備をお願いいたします。
1. 組織サンプルの受け入れ要件
組織について
- 生重量200 mg程度
※ チューブ内のサンプルを全量用いて抽出いたします。弊社で一部を分取する等の対応はお受けできませんのでご了承ください。
※ できるだけ若くて柔らかい葉を送付ください。
※ 二次代謝物が多く蓄積することがわかっている場合には、植物を暗黒条件で48h程度置いてから葉をサンプリングすることを推奨いたします（暗黒処理により二次代謝物が減少し、DNAの収量やN50の改善が見られるとの報告がございます）
受け入れ形態
- 液体窒素で瞬間凍結させた組織を2 mLチューブに入れた状態
- 核酸安定化試薬に組織全体を浸漬し、2 mLチューブに入れた状態
のいずれかでお受け入れいたします。
※ 組織が1本のチューブに入りきらない場合には、数本分に分けてご準備ください。
(例) 解析したいサンプル数が4サンプル、1サンプル分の組織がチューブ2本分
4サンプル x 3本 x 2 = 24 本をご送付ください。
組織サンプル準備方法
液体窒素での瞬間凍結を強く推奨いたします。
液体窒素の使用が不可の場合には、核酸安定化試薬をご使用ください。
核酸安定化試薬を用いての保管をされている場合は事前にご相談ください。
ただし、推奨方法と比較すると抽出ずみ核酸の収量、純度、フラグメントの断片長に差が出る場合がございます。
〜液体窒素での凍結方法〜
- 2 mLチューブを必要サンプル分準備し、チューブの重さを測定しておく。
- 組織を1.で準備したチューブに入れ、チューブごと重さを測定する。
※ 濡れた組織の場合、余分な水分を拭き取ってから重さを測定ください。 - チューブの蓋が隙間なく閉まっていることを確認し、速やかに液体窒素で瞬間凍結する。
蓋が開いたまま液体窒素にチューブを入れた場合、破裂の危険性がございます。蓋が確実に閉まっていることを必ず確認した上で、瞬間凍結をお願いいたします。
- 送付まで-80℃で保管する。
2. サンプルに関する注意事項
- 植物種や組織などによって、抽出条件が異なる場合がございます。事前にお問合せの上、できる限り本番サンプルに近いテストサンプルのご準備をお願いいたします。
- 特殊なサンプルにおいては料金・納期・要件が異なる場合がございます。
- 弊社ではTrizolまたはISOGEN等で溶解済みのサンプルはお受けできません。
3. サンプル送付に関する注意事項と送付先
こちらのリンクにある注意をよくお読みの上、サンプル送付のご準備をお願いいたします。
4. その他注意事項 (必ずお読みください)
弊社にご委託頂く際は、こちらのリンクにある注意をよくお読みください。
5. お問合せ先
株式会社Rhelixa 研究支援事業本部
TEL: 03-6272-3115
