調製済みライブラリーシーケンスのご案内
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※相乗りシーケンスに関する注意点
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Illumina Truseq純正キットをご使用の場合、相乗りシーケンスはお受けできません。
使用不可のキットの具体例:Truseq DNA PCR-free Library Prep Kit
使用可能なキットの具体例:NEBNext® Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina -
ご案内しております納期については、デュアルインデックスのご使用を前提としております。
シングルインデックスをご使用の場合はデュアルインデックスをご使用の場合と比較し、納期が繰延となります。 -
下記の様なケースなど市販のキットを使用せずに調製されたライブラリーについては相乗りシーケンスの都合上、市販のキットを使用した場合と比較し、ご指定のデータ量を著しく下回る可能性がございます点についてはご了承くださいませ。
- 論文等を参考にプライマーを作成して使用した場合
- オリジナルの配列に数塩基を独自に追加して作成したプライマーを使用した場合
※レーンシーケンスに関する注意点
- PhiXの添加をご希望の場合は事前にお知らせくださいませ。
サンプル品質についての注意事項
サンプル品質が十分でない場合、解析の中断・納期の遅延などの可能性があります。
各項目をよくお読みいただき、十分に注意してサンプル調製を行っていただくようお願いいたします。
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比較するサンプルは必ず同じ方法で調製してください。
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タンパク質や有機溶媒等が混入しないようお願いいたします。
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サンプルはNuclease free waterへの溶解を推奨いたします。
EDTAが低濃度(0.1 mM以下)のTEバッファーはご使用可能です。DEPC水は推奨しておりません 。
キットバッファーの組成が不明の場合は製造元へご確認ください。 -
調製したライブラリーはBioAnalyzer, TapeStation, Multina等の測定機器を用いて電気泳動を行い、アダプターダイマーの有無およびライブラリーの分子⻑を必ずお確かめ下さい。測定機器がない場合は、当社までお問い合わせ下さい。
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前記においてアダプターダイマーが検出される場合には、磁気ビーズ等を用いてアダプターダイマー(100-120 bp)が残らないように再精製して下さい。
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ライブラリーをプールされる際は、レーン毎にプールしてお送りください。
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プーリングせずに複数ライブラリーをお送りいただく場合、別途1ライブラリーにつき3,000円+税のライブラリーQC費用をご負担いただきますのであらかじめご了承ください。
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ライブラリーQCをPassしていない場合、データ量については保証いたしかねますのであらかじめご了承ください。
アプリケーションごとの要件の概要
アプリケーション | 濃度 | モル濃度 | 液量 |
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調製済みライブラリーシーケンス | 1 ng/µL 以上 | 4 nM以上 | ※ シーケンサーにより異なります。詳細は下記をご覧ください。 |
※シーケンサーごとのデータ取得量と必要ライブラリー液量
Novaseq X Plus PE150
取得データ量 | ライブラリー液量 |
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30 Gb 以下 | 15 µL 以上 |
30 Gb - 100 Gb | 30 µL 以上 |
100 Gb - 375 Gb | 70 µL 以上 |
レーンシーケンス (出力データ量 : 375 Gb) |
70 µL 以上 (2レーン以上の場合、レーンごとに+ 70 µL) |
※ フローセルシーケンスをご希望の場合はお問い合わせください。
Novaseq6000 PE150
取得データ量 | ライブラリー液量 |
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30 Gb以下 | 15 µL 以上 |
30 Gb - 100 Gb | 30 µL 以上 |
100 Gb - 400 Gb | 50 µL 以上 |
400 Gb - 750 Gb | 70 µL 以上 |
レーンシーケンス (出力データ量 : 750 Gb) |
70 µL 以上 (2レーン以上の場合、レーンごとに+ 70 µL) |
Novaseq6000 PE250、SE50、PE50
取得データ量 | ライブラリー液量 |
---|---|
20 M以下 | 15 µL 以上 |
20 M - 50 M | 25 µL 以上 |
50 M - 150 M | 45 µL 以上 |
レーンシーケンス (出力データ量 : 400 M) |
100 µL 以上 (2レーン以上の場合、レーンごとに+ 100 µL) |
サンプル送付に関する注意事項と送付先
こちらのリンクにある注意をよくお読みの上、サンプル送付のご準備をお願いいたします。
その他注意事項 (必ずお読みください)
弊社にご委託頂く際は、こちらのリンクにある注意をよくお読みください。
お問合せ先
株式会社Rhelixa 研究支援事業本部
service-support@rhelixa.com
TEL: 03-6272-3115